La meditación es la parte más interna del Yoga Hatha, y no consiste en sentarse y dejar la mente en blanco, dino en concentrar la mente y el flujo de pensamientos continuo. Meditar consiste en abandonar, aunque sea por un momento los recuerdos del pasado y las proyecciones al futuro para centrarse en el presente.
Los yoguis aprendieron las mejores técnicas para meditar, o las más efectivas, hace miles de años, y el Yoga no se puede entender sin las prácticas meditativas. Sin embargo siguen apareciendo nuevos métodos para meditar como el mindfulness, que se basan en las meditaciones tántricas clásicas.